滑桃樹不同器官伴生細菌多樣性的分子特征

應用不依賴于培養(yǎng)的16S rRNA基因技術(shù),揭示滑桃樹根皮、莖皮以及種子伴生細菌的種類多樣性,為建立伴生細菌的宏基因組文庫奠定基礎(chǔ).基于我們新近發(fā)表的植物伴生菌富集方法,建立富集和未富集樣品的全長16S rRNA基因文庫,隨機挑取至少100個克隆進行酶切分型并測序,根據(jù)16S rDNA的部分序列推測其所屬伴生菌的種類.結(jié)果表明,所檢測的細菌克隆大部分屬于γ-Proteobacteria,有少量來源于α-Proteobacteria或放線菌(Actinobacteria),也包括不可培養(yǎng)或分類地位不明確的細菌.經(jīng)過富集,16S rRNA基因文庫中細菌克隆的比例和序列多樣性顯著增加,根皮的伴生細菌種類最為豐富,其次是成熟種子和莖皮;幼嫩種子16S rDNA文庫的細菌克隆比例較小(1.18%),說明幼嫩種子的伴生菌最少.

作 者： 王浩鑫 焦軍影 曾英 沈月毛 WANG Hao-Xin JIAO Jun-Ying ZENG Ying SHEN Yue-Mao   作者單位： 王浩鑫,焦軍影,WANG Hao-Xin,JIAO Jun-Ying(中國科學院昆明植物研究所,云南,昆明,650204;中國科學院研究生院,北京,100039)

曾英,沈月毛,ZENG Ying,SHEN Yue-Mao(中國科學院昆明植物研究所,云南,昆明,650204) 

刊 名： 云南植物研究  ISTIC PKU 英文刊名： ACTA BOTANICA YUNNANICA  年，卷(期)： 2006 28(3)  分類號： Q94  關(guān)鍵詞： 微生物富集   植物伴生菌   16S rDNA   微生物多樣性   滑桃樹   不可培養(yǎng)微生物  

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